Structured projects in mathematical biology and stochastic modelling across cellular systems, oncology PK/PD, and reaction–diffusion.
Statistical-Modelling/
├─ Cellular-Systems/
│ ├─ Case1/
│ │ ├─ AdditiveGaussian/
│ │ │ ├─ AdditiveGaussian.jl
│ │ │ ├─ data.csv
│ │ │ ├─ Figure3a.pdf
│ │ │ ├─ Figure3e.pdf
│ │ │ ├─ Figure4a.pdf
│ │ │ ├─ inval_D1.pdf
│ │ │ ├─ inval_sig1.pdf
│ │ │ ├─ inval_v1.pdf
│ │ │ └─ lsp.csv
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│ │ │ ├─ data.csv
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│ │ │ ├─ Figure2a-d.pdf
│ │ │ ├─ Figure2a-j.pdf
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│ │ └─ Multinomial/
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│ │ ├─ Figure3d.pdf
│ │ ├─ Figure4b.pdf
│ │ ├─ Figure4d.pdf
│ │ ├─ inval_D1.pdf
│ │ ├─ inval_v1.pdf
│ │ ├─ lsp.csv
│ │ └─ Multinomial.jl
│ ├─ Case2/
│ │ ├─ AdditiveGaussian/
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│ │ │ ├─ data.csv
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│ │ │ ├─ Figure6a.pdf
│ │ │ ├─ Figure6c.pdf
│ │ │ ├─ inval_P1.pdf
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│ │ │ ├─ inval_sig1.pdf
│ │ │ ├─ inval_sig2.pdf
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│ │ │ └─ lsp.csv
│ │ ├─ Data/
│ │ │ ├─ data.csv
│ │ │ ├─ DiscreteModel.jl
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│ │ │ └─ index2.csv
│ │ └─ Multinomial/
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│ │ ├─ Figure5b.pdf
│ │ ├─ Figure5d.pdf
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│ │ ├─ Figure6d.pdf
│ │ ├─ inval_D1.pdf
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│ │ ├─ inval_q2.pdf
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│ ├─ Case3/
│ │ ├─ AdditiveGaussian/
│ │ │ ├─ AdditiveGaussian.jl
│ │ │ ├─ data.csv
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│ │ │ ├─ ll3.csv
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│ │ │ ├─ MLE1.pdf
│ │ │ ├─ MLE2.pdf
│ │ │ └─ MLE3.pdf
│ │ ├─ Data/
│ │ │ ├─ data_0.csv
│ │ │ ├─ data.csv
│ │ │ ├─ DiscreteModel.jl
│ │ │ ├─ FigureS6.jl
│ │ │ ├─ FigureS6.pdf
│ │ │ ├─ index1.csv
│ │ │ ├─ index2.csv
│ │ │ └─ index3.csv
│ │ └─ Multinomial/
│ │ ├─ data.csv
│ │ ├─ FigureS7b.pdf
│ │ ├─ FigureS8b.pdf
│ │ ├─ FigureS8d.pdf
│ │ ├─ FigureS8f.pdf
│ │ ├─ IID1.csv
│ │ ├─ IID2.csv
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│ │ ├─ lsp.csv
│ │ ├─ MLE1.pdf
│ │ ├─ MLE2.pdf
│ │ └─ MLE3.pdf
│
├─ Oncology/
│ ├─ PK-PD-Modelling-to-Assess-the-Effects/
│ │ ├─ Code/
│ │ ├─ Dissertation/
│ │ │ ├─ Dissertation.pdf
│ │ │ └─ README.md
│ │ └─ Test/
│ └─ test/
│
├─ Reaction-Diffusion/
│ ├─ 2.6.ipynb
│ ├─ 2.14.ipynb
│ ├─ 2.15.ipynb
│ └─ README.md
│
└─ test/